580年夏，孙思邈在山上守墓快两年了。某日，李丁兴冲冲的来到太白山，一见孙思邈便笑道：“好消息，天元皇帝病死了，现今一个八岁的小毛孩当皇帝。”
孙思邈道：“怎么，你对此有想法？”李丁道：“以前不是有个相士说我能当皇帝，我觉得现在就是最好的时机。”
孙思邈道：“怎么，你年年纳妾还不满足，非得弄个后宫佳丽三千？”李丁道：“这不是看东方朔年年换妻，我就来个年年纳妾。可恨有个杨坚在那碍手碍脚。”
孙思邈道：“我劝你，还是安心做好你的刺史，想要当皇帝风险是很大的。”李丁道：“我可不像你，整天无欲无求的，这事我自己会考虑的。这次又给你弄了些吃的用的。还有这本陈延之的《小品方》，我自己写的《常才读医经》，甄谋的《女人心医解》，这些都留给你。”
孙思邈道：“常才，你这是来交代后事呢？倒是不像来看望我的。事不可为，你就别强求了。这是我写的一首《枕上记》，你就带着时常看看。”
李丁将帛书接在手上，见上面写的是：
侵晨一碗粥，夜食莫教足。
撞动景阳钟，扣齿三十六。
大寒与大热，且莫贪色欲。
醉饱莫行房，五脏皆翻覆。
坐卧莫当风，频于暖处浴。
食饱行百步，常以手摩腹。
莫食无鳞鱼，诸般禽兽肉。
自死禽与兽，食之多命促。
土木成形象，求之有恩福。
父精母血生，那忍分南北。
惜命惜身人，六白光如玉。
李丁下山走了，孙思邈看着他消失的背影，心中有着隐隐的不安，自己是否劝动了常才，放弃心中的皇帝梦。
过了月余，有一个十五岁的少年，匆匆跑来了太白山，见到了孙思邈便叫道：“孙叔叔，你可得救救我。”
孙思邈曾见过这个少年，有一次李丁带着他上过山，便道：“叔德，这是怎么了？”
李渊道：“我四叔被杀了，全家都被杀了。是我姨父派人干的，我该怎么办，我现在该怎么办？”
孙思邈道：“你先别慌，你好歹是唐国公。你四叔自小就过继出去了，牵连不到你。”
李渊道：“我本打算去见姨父姨母，向他们认罪求情，他们不见我。”
孙思邈道：“叔德，你有什么罪？又去认什么罪？你现在最好就是在家里好好待着。快点回去吧！那罗延他刚掌大权，不敢滥杀无辜的。”李渊听后，怱怱带着几个护卫回去了。
孙思邈此时是既伤心又失落，常才终究还是没听自己劝，陷进了自己的皇帝梦中，最终也死在了自己的皇帝梦中。三十多年相交的朋友，亲如兄弟的发小，曾经陪伴自己一起经历过凶险的人，就此失去了。
李渊刚走了没两天，卢贲司武便来到太白山传旨。孙思邈见他带着的近百府卫，军容整肃，脸带杀气，应该都是经历过沙场的老兵。孙思邈也不敢怠慢，将卢贲迎入院中。
卢贲打开诏书念道：“大周皇帝诏曰：孙融品德端方，才学出众。后为奸人构陷，遭贬抄家，奸臣宇文护蒙蔽圣听，武帝不查，未能平反。当今圣上英明，为其平反，复孙融太子洗马之职，追封太子太傅；其子孙孝冰，仁孝尚德，追封华原县丞，妻杨氏追封县丞敕命夫人；孙融之孙，孙思邈，博学多才，医道精深，人品出众，征为国子博士，适时进京赴任，钦此。”
孙思邈接过诏书道：“我痛失双亲，气血双亏，早生华发，实在不便入京。等守孝期满，身体好转，定当入京。请将军如实回禀左大丞相。”
卢贲道：“本人卢贲，现为司武上士。大丞相曾言，他甚为思念表哥，已有二十七年未见，希望能与你早日相会。今见孙大人确实不便，我定当如实回禀。”孙思邈客气的送卢贲下山了，顺手还送了一万钱的路费。
话说此时的巫山上，灵儿向圣女汇报了最近的一些情报。灵儿道：“禀圣女，李丁已死，全家被灭，只有长子和次子，不知所踪，安插在其身边的五位小妾，已安然回归圣教。”
圣女道：“真是个无用的蠢货，浪费圣教这么多心血将其培养起来，才斗了一个回合就死了。”
灵儿道：“真是世事难料，怎知杨坚这个佛秃子，这么快就执掌了周朝大权。他日后必定大兴佛教，这对圣教十分不利。”
圣女道：“我看独孤伽罗才是我教大敌，杨坚也是个怕夫人的。独孤伽罗精明强干，崇信佛教，得尽早除掉才行。”灵儿道：“好的，属下会尽快想出对策。”
孙思邈刚听闻李丁死讯，又接到杨坚的诏命，正在思量间。忽然孙和跑来了太白山，向孙思邈通知了老孙头的死讯。
孙思邈匆忙同孙和回到了李家塬，推开家门，只见老孙头安祥的躺在床上，好像是进入了梦乡。也许在梦里他正逗弄着少爷的儿女呢？前不久孙思邈还让孙和谎称自己的四名侍妾都怀上了，可把老孙头激动坏了，竟然又想亲自上山看望孙思邈。还好被能说会道的孙和给拦住了。
老孙头在送四女上山后，还是有些不放心，便在一个月后又上了一次太白山，见四女都被少爷宠幸过，这才放心下山了。从此之后，他都是安排孙和上山给孙思邈等人送吃的用的。老孙头则在李家塬安心等着将来抱小少爷。头一年没怀上，老孙头就急了，想要上山看看。孙和那敢让他上山，便劝老孙头，俗话说的“皇帝都不急，你太监急啥？”，要他去找村里的老人问问。结果老孙头找了几个年龄和他差不多的老头一问，这才放心了。因为他们说媳妇娶过来第一年能怀上的很少，但是在三年内一定会怀上。只有在三年内还是怀不上，才能确认小夫妻俩身体有问题，要去找郎中看一看，给俩人治一治。
孙思邈亲自给老孙头做了一口上好的棺材，将他也送到太白山上安葬了，就葬在父母的旁边。孙思邈没有表现的非常悲伤，他已经学会将悲伤藏在心里，男儿有泪不轻弹。从此孙家的长辈全部离世，孙思邈成了孙家真正的老爷。他感觉延续孙家香火的压力扑面而来。