皇太子刘彊见母后郭圣通被废，就知大势已去。在郅恽的劝说下，他决?7??向刘秀请辞太子之位。刘秀一开始一直摇头不同意。刘彊再辞、三辞、多次辞…刘秀则一直沉默不语，不作回答…
一年半多来，皇太子刘彊一再请辞，说愿意降级当诸侯王，太子之位就留给皇后阴丽华所生的儿子吧…终于6月26日，刘秀点头了，废除刘彊的太子之位，改封东海王。但刘彊是个乖孩子，所以刘秀告诉他“王位是给你封了，但你不用急着就国，可以呆在洛阳多玩玩”同时刘秀立自己的第四子、阴丽华所生的长子、东海王刘阳为太子，并改名刘庄。
之后，刘秀又封阴丽华的哥哥阴识为执金吾、弟弟阴兴为卫尉，辅导太子。封桓荣为议郎，教授太子经书。命钟兴教授太子及诸王《春秋》，赐钟兴关内侯的爵位。钟兴辞以无功，刘秀说“你替朕教育太子及诸王，这岂非大功”钟兴答“这都是我师父丁恭教我的”于是刘秀下令封赏丁恭，而钟兴仍固辞不受。
9月21日，刘秀行幸南阳郡，随后又去往汝南郡南顿县。刘秀的父亲刘钦是南顿县令。刘秀就在父亲当年的县舍内置酒会，赐吏民，当场下令免除南顿县一年的田租。南顿县父老叩头进言“愿免十年”刘秀道“天下重器，常恐不任。朕不能料到十年之后的事呢”南顿县吏民又说“陛下您万岁万岁万万岁，何必言谦呢”刘秀大笑，决定再免除一年。之后，刘秀又巡幸了淮阳、梁、沛等郡。
西南夷栋蚕在去年联合各部落一起造反，攻杀长吏。益州太守繁胜兵败后，退保犍为郡朱提县。本年，刘秀命刘尚率军平叛。进军路上要经过邛谷王任贵所在的越巂郡。任贵担心汉朝一旦平定了这场叛乱之后，接着便会来对付自己。于是决定先下手为强，以****为名，要用毒酒暗害刘尚及汉军。谁知阴谋泄漏。12月，反而被刘尚抢先占据越巂郡治邛都县，袭杀任贵。
本年，刘秀下令修缮长安宫室，复置函谷关都尉。
刘秀的大姐、湖阳公主刘黄自宋弘拒婚后，一直寡居在家。刘秀也格外怜悯，厚赐财物，因此湖阳公主家中豢养家奴数百，难免有良莠不齐之辈。甚至有苍头白日杀人之后，便躲在公主家中，地方官员也不敢进去抓捕。包括洛阳令董宣，他也只能每天在公主门外候着，希望能有机会当场法办这个杀人凶手。终于机会来了…
这一天，湖阳公主出外郊游，竟让这个苍头做自己的骖乘。董宣这一天也正好在夏门亭等候，见杀人凶手出门了，当即走上前去，驻车叩马，以刀画地，直斥湖阳公主包庇之罪，并严叱那个苍头下车，就在公主面前直接把这个杀人凶手格杀了！
湖阳公主刘黄当即回宫来见自己的皇帝三弟刘秀哭诉。刘秀也不禁动怒，召董宣入宫，责他冲撞公主之罪，要棰杀他，给公主出气。董宣叩头道“臣有一言，愿说完而死”刘秀问“什么话”董宣说“陛下圣德中兴，却又令公主纵奴杀人，这将如何治理天下？臣说完了。也不用棰杀，臣就自己撞死在这大殿上就好了”说完果然以头撞柱，血流满面。刘秀急忙让小黄门把董宣拉住，说“你就叩头给公主陪个不是就好了”但董宣宁死不肯叩这个头。刘秀让小黄门按住董宣的头，想强行让他对公主口头。没想到董宣两手据地，终不肯俯。
湖阳公主刘黄见到这一幕也说话了“三弟当年为白衣时，尚在家中藏匿亡命之徒，吏役不敢上门。如今做了天子，反不能威行一令吗”刘秀笑答道“天子与白衣不同”转头又对董宣道“你果然是个强项令。没事了，你出去吧”为此事，刘秀特赐董宣三十万钱，董宣将这笔钱全部分给了下属。从此强项令之名威震京师。董宣搏击豪强，京师震恐。
建武20年（44）4月3日，大司徒戴涉因太仓令奚涉之案，有失察之罪，下狱而死。三公中的另一位大司空窦融也被牵连罢官。5月4日，大司马吴汉去世，送葬如西汉大司马霍光故事。吴汉病重时，刘秀亲临探望。吴汉遗言“臣本愚蒙，无甚知识。只愿陛下慎勿轻赦”
5月，匈奴侵犯上党、天水二郡，游骑甚至深入到了右扶风境内。
5月，刘秀犯风眩之疾，在云台广室召见皇后阴丽华的弟弟阴兴，封他侍中，领受顾命。病愈之后，再次召见阴兴，这次想让他接任大司马。阴兴叩头流涕，固让不为。还有太子太傅张湛，自郭皇后被废之后便称病不朝，刘秀也强起之，要封他为大司徒。张湛也固辞疾笃。最后刘秀都只得做罢。6月14日，刘秀封广汉太守蔡茂为大司徒、太仆朱浮为大司空。16日，封刘隆为骠骑将军，行大司马事。
19日，刘秀改封次子、中山王刘辅为沛王。封刘辅的舅舅郭况为大鸿胪。在郭圣通被废后，刘秀对她的弟弟郭况仍然很好。数幸其府第，赏赐金帛，丰盛莫比。甚至郭况之家被洛阳的百姓称为“金穴”
9月，马援凯旋回朝，对前来迎接他的孟冀说了一番话“如今匈奴、乌桓还在侵犯北部边疆，我欲自请击之。男儿当死于边野，以马革裹尸还葬。怎能卧于床上，死在儿女子手中呢”孟冀道“此言壮哉！为烈士当如是矣”
秋天，东夷韩国人率众来到乐浪郡，求内附。
12月，匈奴侵犯天水、右扶风、上党三郡。马援便自请出击匈奴。刘秀就给了他三千骑兵，让他出屯赵郡襄国县。马援出发时，刘秀命百官在都门给马援送行。送行队伍中有两个人：窦融弟弟窦友的儿子窦固、梁统的儿子梁松。
老爹种树，儿子乘凉。梁统长子梁松得势甚快，娶了刘秀的长女舞阴公主刘义王，成了乘龙快婿。窦固也托了伯父窦融的福，娶了刘秀的次女涅阳公主刘中礼，成了另一乘龙快婿。家族显赫，地位不凡，如此能量，谁敢小觑？但偏有人不买这两位驸马黄门郎的帐：普天之下也就只有马援了！
送行，是体现后生对前辈的尊重。可前辈马援并不领情，他相当严肃地告诉这两个后辈“人居高位，要时刻记得自己是从哪里来的。要长保富贵，就应居安思危，小心自保”马援的话是句实话，可非常伤人！马援以为：自己和窦融、梁统都是老朋友，以长辈身份教育两个得意俊生，也没什么不妥？可事实上，他错了！他并不知道：在梁松、窦固这两个高干子弟看来，面子不是自己挣来的，而是别人给的！
连皇帝岳父刘秀都给他们面子，可马援却连一句客气的话都不会说！跟他搭伙还有啥意思？不如直接拆台走人算了！
本年，刘秀下令撤销五原郡，将官吏百姓迁到河东郡。还下令免除陈留郡JY县百姓的6年徭役。
建武21年（45）1月，刘尚率军一直追到益州郡不韦县，终于斩杀曲帅栋蚕，西南诸夷悉平。
4月，安定属国胡人反叛，屯聚青山。被陈忻率兵讨平。
匈奴、乌桓、鲜卑三族经常连兵为寇，代、上谷、渔阳、右北平、辽西这沿边五郡深受乌桓之害。郡县损坏，百姓流亡，边陲萧条，无复人迹…天苍苍，野茫茫，风吹草低见牛羊，似已是遥远的传说！
在上谷郡塞外白山的乌桓部落最为强悍。8月，马援率三千骑兵出击，却无功而还。只能与谒者一起在边境上分筑保塞，稍立郡县，空置太守、令、长。招还人民。
8月，鲜卑万余骑侵犯辽东郡，辽东太守祭肜率数千人出击，大败鲜卑骑兵。自此鲜卑震怖，不敢犯塞。
10月，匈奴侵略上谷、中山二郡。
西域诸国叫苦连天，因他们那里的黑老大、莎车王贤在当地大打出手！打得西域诸国不宁，鸡飞狗跳。冬天，车师前、鄯善、焉耆等18国再次遣子入侍，贡献珍宝，见到刘秀后更是流涕稽首，请求刘秀一定要重设西域都护，维持西域的秩序。
可光武皇帝刘秀是铁了心要放弃西域的。他没精力、没军力、没时间、没心情整理这民族问题。王莽留下的这个烂摊子实在太大，刘秀要收拾的地方实在太多了。于是刘秀委婉地告诉西域使者“你们来这一趟也不容易。你们带多少东西来，就带多少东西回去，我顺便再送你们些好东西回去吧”可使者们一听这话，心都凉了。
等到诸国侍子要返回各自国家，西域诸国国王更是忧恐，只能联名给敦煌太守裴遵写信“洛阳不肯收留我们的侍子，我们请求把侍子留在敦煌郡。这样就能骗那个莎车王贤，说皇帝您已同意派出西域都护了。只希望这样能吓住那个贤，让他罢兵”裴遵将此信转交刘秀，刘秀不置可否。
建武22年（46）5月30日，日食。7月，司隶校尉苏邺下狱而死。9月5日，地震。刘秀下诏免租、减刑、救灾。
10月19日，大司空朱浮被罢。20日，光禄勋杜林被提拔为大司空。刘昆被任命为光禄勋。刘昆当年任JL县令时，遇着火灾。他向火叩头，火竟熄灭；后来任弘农太守时，辖境内的老虎都不吃人，反而驮着孩子们渡河。刘秀也感到很好奇，特意召问刘昆这二事是真是假？刘昆答道“是真的，不过都是偶然罢了”左右听了，不禁窃笑。刘秀叹道“这真是忠厚长者啊！言无需饰。若他人作答，不是自夸，便是贡谀了”
本年，青州蝗灾。
本年，匈奴呼都而尸道皋若鞮单于去世，其子左贤王乌达鞮侯继任为大匈奴最后一任单于，但很快也死去。其弟左贤王蒲奴继任单于。大匈奴即将分裂！原因在于这个人：被王莽搞掉单于之位的乌珠留若鞮单于！当时王莽改印为章、改匈奴为服奴，让乌珠留若鞮单于很是不满。他死后，在王莽的支持下，乌珠留若鞮单于之弟咸做了单于。咸死后就是呼都而尸道皋若鞮单于。但乌珠留若鞮单于有一个儿子叫比，当时在匈奴是右薁鞬日逐王，领南边八部。
话说呼韩邪单于儿子众多。bc31年他死后，从复株累若鞮单于到呼都而尸道皋若鞮单于，已兄终弟及了六代77年，而呼都而尸道皋若鞮单于还有一个弟弟、右谷蠡王知牙师(我实在很想知道这个家伙该是多大了？)按兄终弟及的传统，应该是知牙师继位。但呼都而尸道皋若鞮单于为了传子，竟将弟弟知牙师诬杀。如今虽顺利传子，但已引起了比的强烈不满“以兄弟言之，当立右谷蠡王。以子言之，我乃是前单于之子，难道不该立我吗”
比派使者来到渔阳郡，请求与汉朝和亲，以求得汉朝支持自己随时觊觎匈奴单于大位。刘秀派中郎将李茂出使匈奴。
不仅面临分裂危机，匈奴近年来还连遭旱、蝗之灾，赤地数千里，人畜饥疫，死耗太半。乌桓乘此良机，强势崛起！本年，乌桓大破匈奴，匈奴北徙数千里，幕南之地一空。刘秀下诏：废除边郡上的亭候、吏卒，派人出使乌桓，以币帛招降之。
西域诸国侍子久留敦煌郡，各怀归志，于是纷纷返回西域。这下，莎车王贤兴奋了：原来没有西域都护这档子事啊！立刻发兵！攻破鄯善国、攻杀龟兹王。鄯善王安无奈最后一次给刘秀上书“我再次恳求：遣子入侍，请您派出都护以维持西域的秩序。如您实在不帮忙，我们就只好投匈奴去了”刘秀回答“你们的心情，我很理解。但汉朝现在的确很困难，没军队给你们派去。不好意思，向东、向西、向南、向北，就随你们的便好了”终于鄯善、车师等国重新归附于即将大分裂、都已自身难保的匈奴…
《汉书》的作者班固盛赞刘秀放弃西域之举“与汉隔绝，道里又远。得之不为益，弃之不为损。盛德在我，无取于彼。故自建武以来，西域思汉威德，咸乐内属，数遣使置质于汉，愿请都护。圣上远览古今，因时之宜，辞而未许。虽大禹之序西戎，周公之让白雉，太宗之却走马，义兼之矣”但在我看来，此举却是光武皇帝刘秀的极大失策！班固的弟弟班超恐怕也大不以为然，未来他将率36勇士，为刘秀之子、汉明帝刘庄收复西域！而大大的打上刘秀、班固一个大耳光！